也正是因為這一點，當零號機跟綾波麗一起消失的時候，碇源渡更多的是擔憂自己的計劃會不會出現意外以及憤怒。
至于擔心，那是什么？
別說綾波麗了，就算是他的親生兒子碇真嗣，他也不過是將其當成一個可以利用的棋子，工具而已，就更不要說本來就是制造出來的工具人綾波麗了。
因為，在發現綾波麗跟零號機消失之后，碇源渡第一時間就是關注零號機的去向，在得知完全消失之后，他沒有在問什么，默默的前往地下基地的某個位置。
那個地方，存儲著數量不菲的綾波麗克隆體，現在碇源渡要去看看能不能喚醒一號，將莉莉絲的靈魂重新喚醒融入到綾波麗的復制體之中。
本來，擁有這種大殺器在手，碇源渡根本就一點都不擔心，因為只有他掌握了這種讓綾波麗復活的方法，所以他根本就不擔心莉莉絲的靈魂會消失。
但是，當他試圖喚醒一號備用身體的時候卻發現，他沒法喚醒一號，也就是說，零號根本就沒有死。
雖然他能夠將莉莉絲的靈魂召喚回來，讓她進入特定的身體之中，但現在零號還沒有死呢。零號都沒死，莉莉絲的靈魂自然不會離開零號的身體，而莉莉絲的靈魂不離開，他自然也就無法召喚了。
這一下，碇源渡有點慌了，因為這件事已經超出了他的掌控了。
如果沒有莉莉絲的話，人類補完就無法實行，如果人類補完無法實行的話，他就無法借助亞當的**成神，無法重新跟他逝去的妻子重逢。
碇源渡所在的一切，其實都是為了跟自己當年因為實驗發生意外消失在初號機當中的妻子重逢，也正是因為如此，他要實施的其實并不是人類補完計劃，亦或者說并不是單純的人類補完計劃。
他要做的事情，其實是想要讓初號機成神，然后自己在借助移植到自己手臂當中的亞當肉身成神，這樣他跟他的妻子將會成為新的亞當跟莉莉絲。
而其他人類，他們將會在莉莉絲被放出來，初號機成神之際重新回歸LCL海洋，重歸一體，在不分你我，意識共通，成為第十八使徒，李林，從此無病無災，沒有壽元的限制。
但是現在，他這個計劃之中最重要的其中一個棋子消失了，這如何能讓他不憤怒。
不過在憤怒也沒有用，因為他確實找不到綾波麗了，而且沒有沒有絲毫的線索。
是的，就是沒有絲毫的線索，無論是監控，還是基地亦或者使徒都沒有任何的異常，也就是說，零號機的消失，有很大的可能并不是使徒做的。
至于是不是基地之中有叛徒，將零號機給藏起來帶走了，這種事情根本就不可能。
作為基地的最高指揮，碇源渡還是很有信心的，他不相信有人能夠瞞著他在眾目睽睽之下將如此龐大的零號機帶走。
而且，零號機消失的時候他雖然沒有看著，但他也在附近，也就是說，如果有人真的這樣做了，那不可能瞞得過他的。
碇源渡到底是怎么想的，他又想要做什么葉赫不知道，也不想知道，他現在已經被驚到了，因為在將綾波麗收入自己的世界之后，綾波麗的身上突然出現了世界意識獨有的氣息。