六腑，即膽、胃、大腸、小腸、膀胱和三焦。
奇恒之腑也屬于腑，但又異于常。系指腦、髓、骨、脈、膽和女子胞。這里邊膽即是大腑之一，又屬于奇恒之腑。
臟腑雖因形態功能之不同而有所分，但它們之間卻不是孤立的，而是相互合作、相互為用的。
經絡系統可以分經脈、絡脈和腧穴三部分。經脈有正經十二:手太陰肺經、手陽明大腸經、足陽明胃經、足太陰脾經、手少陰心經、手太陽小腸經、足太陽膀胱經、足少陰腎經、手厥陰心包經、手少陽三焦經、足少陽膽經、足厥陰肝經。十二經脈首尾相聯如環無端，經氣流行其中周而復始。另有別于正經的奇經八脈:督脈、任脈、沖脈、帶脈、陰蹺脈、陽蹺脈、陰維脈、陽維脈。(注:“奇經八脈“一名始于《難經·二十七難》)
經脈之間相交通聯絡的稱絡脈。其小者為孫絡不計其數;其大者有十五，稱十五絡脈。《靈樞·經脈》敘述的非常詳細。
腧穴為經氣游行出入之所，有如運輸，是以名之。《黃帝內經》言腧穴者，首見《素問·氣穴論》，再見于《素問·氣府論》，兩論皆言三百六十五穴。實際《氣穴論》載穴三百四十二，《氣府論》載穴三百八十六。
精氣神為人身三寶。精，包括精、血、津、液;氣，指宗氣、榮氣、衛氣;神，指神、魂、魄、意、志。精和氣是構成人體的基本物質，氣和神又是人體的復雜的功能，也可以認為氣為精之御，精為神之宅，神為精氣之用。
折疊病機學說
研究疾病發生、發展、轉歸及變化等等之內在機理的學說稱病機學說。
《素問·至真要大論》所說“審察病機，無失氣宜“、“謹守病機，各司其屬“都是此學說的內容。
1.病因:引起人發病的原因很多，《黃帝內經》將其歸納為二類。風雨寒暑實為“六淫“的概括;陰陽喜怒乃“七情“的概括;飲食居處即“飲食勞倦“。可以認為這就是后世三因說之濫觴。
2.發病:正邪雙方力量的對比，決定著疾病的發生與發展，這就是“正氣存內，邪不可干“之意。《素問·上古天真論》所說“精神內守，病安從來“，《素問·評熱病論》所說“邪之所湊，其氣必虛“等，都論證了這一點。
3.病變:疾病的變化是復雜的，《黃帝內經》概括病變也是多方面的，有從陰陽來概括的，用表里中外歸納的，用寒熱歸納的，從虛實而論者，實指邪氣盛，虛指正氣衰。概括說來，有正虛而邪實者，有邪實而正不虛者，有正虛而無實邪者，有正不虛而邪不實者。
折疊診法學說
望聞問切四診源于《黃帝內經》。
1.望診:包括觀神色、察形態、辨舌苔。
觀神色者，如《靈樞·五色》、《靈樞·五閱五使》和《靈樞·五色》所載，這些在臨床上都很有意義。
察形態者，是察看人的骨肉皮膚而推斷病情，在臨床上虛實是錯綜復雜的，只有知其常，才能達其變。
辨舌苔者，如《素問·熱論》、《素問·刺熱論》和《靈樞》所載等等。
2.聞診:包括聞聲和嗅氣味。
聞聲音者，是聽患者的聲音而診斷病情。
其次是嗅氣味，如《素問·金匱真言論》所說，肝病其臭臊，心病其臭焦，脾病其臭香，肺病其臭腥，腎病其臭腐。
戰國時期