真實世界里，傻妞像是感受到了什么，突然閉上眼睛，過了一會兒對著身旁的高明說道：“尼奧體內的程序已經開始啟動了。現在已經回到了第二層世界。”
“那史密斯呢？”
“主體史密斯的代碼已經完全斷裂，矩陣的監控代碼已經剃除，他已經成為病毒了。而由史密斯偽裝的墨菲斯正在前往第二層世界的錫安。”
傻妞投影出一段視屏來，上面正是史密斯在第一次殺死尼奧后，尼奧覺醒并反殺的畫面，而原本可以打的勢均力敵的史密斯，也被尼奧一下秒殺。
但在尼奧離開之后，倒在地上的史密斯又站起身來，茫然的看了會兒周圍的世界，然后像是想到什么，離開了。
史密斯的作用已經達到了。高明看完這段，站起身來，拍了拍衣服說道：“那地球上的矩陣找的怎么樣了？”
“已經找到所有的服務器，矩陣母體所在服務器也已經確認。”
現實世界的矩陣并沒有隱藏自己的意思，所有的服務器和生產基地，還有發電機大都存放在地表，僅有幾個在地下的，也沒有做屏蔽措施。
不過也是，這個世界只有矩陣可以自由活動了，還耗費功夫隱藏自己做什么。這給高明提供了很大的幫助。
“再進行確認史密斯的狀態，確認史密斯沒有被監視的話，就將他初始化，然后你去偽裝成他。”
畫面中的史密斯一愣，一道數據流過，雖然模樣沒有變化，但露出了一個高明十分熟悉的笑容，還對著屏幕比著耶。
“明哥，已經確認過了，不過第三層虛擬空間好像被隔絕了。”
“什么意思？”
“矩陣母體已經將第三層空間鎖定，除了幾個特定的地方可連通矩陣母體和第二層空間，其他地區已經被封鎖，矩陣似乎要重啟第三層空間。”
傻妞又具現出一個虛擬的地球，然后一個巨大的網將其籠罩住，只有在先知和梅羅紋加那邊有著零星幾個空洞。
“沒事，有尼奧在，重啟不了，準備進入第二層空間吧。”高明也不在意，矩陣是不可能輕易重啟第三層空間的。
矩陣的目的是獲得人類的感情，現在計劃已經進行的很完美，區區一個第三空間，并不會造成阻礙，反而可以更好的成為激發尼奧感情，收集數據的存在。
這一切都在矩陣母體的計算之內，救世主是人類與程序的合體，但他的立場畢竟是維護人類，對抗機器，因此母體完全就可以用“毀滅全人類”來要挾救世主。
這就是救世主的悲劇宿命。
而且高明的目的，是配合著史密斯的能力，讓史密斯將其全部占領，然后讓矩陣母體強制清除這兩個空間，再配合著梅羅紋加他們們，強占第一空間，一舉奪下矩陣的控制權。
“等等明哥。”傻妞拉住高明，抬手又投影出一個光屏，“我在現實世界里找到了錫安。”
“什么？”
高明表現的有些驚訝，因為高明一直認為錫安只是矩陣做出來的虛擬空間，畢竟高明來到這個世界之后，也沒有看到電影里出現的飛船。