第一點就是教義的矛盾。
天主教義堅持上帝是最高權威，上帝面前人人平等，這和以將軍為最高主宰、嚴分身份等級的幕藩體制完全不同，且完全抵觸。
第二點就是天主教的排它性，天主教否定神佛信仰，認為上帝是天地萬物之主，應該服從上帝，而不應該服從父母、主人、君主。
這對自稱“神國”的日本和被尊為“天照大神化身”的德川統治者來說，更不能容忍。
此外，天主教反對日本武士的切腹、多妻制，都直接和日本統治階級的傳統對立。
這些矛盾點結合在一起，哪怕沒有新教基督國英國、荷蘭商人對西班牙、葡萄牙舊教天主教士的中傷，日本政府也絕不會允許天主教在日本繼續發展。
便是放在大明，哪怕魏公公是龐麥臣大主教，他也不可能讓天主教的舊教義在中國傳播。
所以，改良天主教義，堅持中國化道路，否定天主教的排它性，將上帝與東方文明神話結合在一起，才能讓天主教真正的為公公所用。
去年公公在北京南堂召開的中國化道路工作會議中，就教義改革公公曾經提出若干點。
“東風一定要壓倒西風！”
“人口數量占據第一的皇明一定要在宗教領域蓋過人口較少的族群。”
“和西方的交道過程中，我們必須清醒認識到天主教、基督教乃至各大教派于西方各國人民的影響，信仰這個東西我們不去爭取，不去控制，不去把握，我們的敵人就會加以利用。”
正在編緝的《魏公文選》第六卷中有關宗教部分就引用了魏公的幾次講話。
私下里，魏公公更是毫不避諱的和郭居靜等人提出，東方教區現在及未來唯一的奮斗目標就是將天主教世界的領導權接管過來。
“如果我們的教區面積最大，如果我們的信徒人數最多，如果我們的圣斗士們最強，為什么我們還要聽從梵蒂岡的命令？”
“教宗、教皇又為什么一定要由西方人擔任？難道東方人就不是上帝的子民了么？”
同樣的道理引用在日本，也同樣適用中國化（東方化）。
日本，是一個微縮版的中國。
魏公公很明確的對那幾個日本天主教人士提出今后天主教應當和儒教、佛教、神道教融合，入鄉隨俗，只有爭取到多數人的贊同，天主教才能為上帝爭取更多的東方信徒。
“從前耶穌會的做法是錯誤的，我們必須糾正，如果繼續從前的錯誤做法，對教士和信徒們的傷害就是無法挽回的。”
如果有可能，魏公公很想現在就出版改良版的《圣經》，但顯然現在推出新《圣經》并不實際，因為東方教區現有的實力遠不能和西方各教區相提并論。