“現在各國的平衡隨時都會被打破，此刻正處于戰爭的邊緣，不先動手毀滅別人就會被別人毀滅，這是個一旦猶豫就會被干掉的世界。”
這是一個襲擊自來也的女忍者，自來也打敗了她，但也停止了旅行，回木葉里作為木葉里的一員參加戰斗。
回到村里，就得知千手綱手的弟弟死了，戀人也死了，看著痛苦的千手綱手，自來也很是心疼。
為了抹去忍者的世界里的這股悲傷，必須要找到變革者，必須找到那個能夠給世界帶來和平的人。
“這就是我們忍者的命運，只要我們還生活在這個被詛咒的忍者世界里，就不會有和平。”
這是戰場上遇上的一個忍者，自來也突然醒悟到，應該自己培養弟子，培養出能給這個世界帶來和平的變革者，不管花多少時間，只要世界上有和平這種東西，就一定要抓住。
第三次忍界大戰全面爆發，就在雨之國，自來也、千手綱手、大蛇丸與雨隱里的山椒魚半藏一戰，獲得了山椒魚半藏的認可，成為傳說中的三忍。
而在那之后，自來也在雨之國遇上了三個找食物的小孩子，彌彥、小南、長門，他們的家人被木葉里忍者殺了。
他們三人想學習忍術，大蛇丸本來要殺了他們，但自來也決定收他們當弟子，作為木葉里的補償。
“等國與國之間也會相互理解獲得和平，那只是一廂情愿而已，我們的家人都被殺害了，如果要相互理解的話，至少也要讓對方嘗嘗同樣的痛苦，這才算是分享痛苦吧，所以戰爭才無法停止，我要變強，我要保護大家，我要改變這個國家。”
彌彥的思想是以武力改變國家，但是要讓對方嘗嘗同樣的痛苦，那就無法讓戰爭停止，自來也想要的是，讓人能放棄怨恨，重新構筑并貫徹和平。
小南的能力是控制紙，她自己并沒有強烈的思想，只是在跟隨彌彥。
長門的思想是保護他的家人，現在，也就是彌彥和小南。
在一次彌彥和長門遇襲時，長門殺死了襲擊他們的忍者，自來也發現長門具有傳說中的輪回眼。
三大瞳術中被認為是最崇高的輪回眼，忍者始祖的六道仙人才具有的眼睛。
據說現在所有的忍術，都是由那位擁有輪回眼的仙人所創造出來的。
他是在世界陷入混沌之時，用手孕育一切的創造神，也可以是將一切歸零的破壞神。
自來也相信他和長門相遇，收長門為徒，是命運的相會。
“那個時候，彌彥受傷了，我非常生氣，等我回過神來的時候，對方已經倒下了，我感到非常害怕，因為憎恨，迷失的我將對方給我可能做錯了，應該會有更好的方法。”
長門的懺悔，自來也很高興。
“長門，你這么做對不對我也說不清，不過多虧了你，彌彥才能得救，你保護了朋友，所以你做的事應該是正確的，沒有人會責備你。”
“一旦受到了傷害就會產生仇恨，相反，如果去傷害別人就會招人怨恨，同時也會受到自己良心的譴責。”
“正因為知道那份良心的傷痛，今后才能以寬大的胸懷待人，這就是我希望你們能夠成為的人類。”
可惜，原以為他們可以靠他們自己的力量來改變雨之國，但他們三人后來居然都死了。
另一個弟子，波風水門雖然出色，但是感覺總是差一點，沒有那種命運的感覺。
一直到那天，波風水門看了自來也根據自身經歷和希望而寫的毅力忍傳一時興起把里面主角的名字拿去給了他未出生的孩子漩渦鳴人。
自來也有一種命運的感覺，與那個未出世的孩子。
自來也在胡思亂想中，走進了雨之國的都城雨之城，輕而易舉的。
六月上旬，雨之國。