而在這個時候，被國王留下來管理巴西的佩德羅王子卻毅然決然的選擇留在巴西，還主動肩負起了巴西獨立派領袖的重任。
這位從拿破侖戰爭時期便隨父親流亡巴西的王子對這片土地有著相當濃厚的感情，而為了避免巴西重返殖民地地位，佩德羅王子甚至發出了哪怕在他老爹看來都是十分眼前一黑的言論。
佩德羅王子得知消息的第一時間，便氣憤的高呼“就算要合并，也應該是四流國家、窮國葡萄牙并入一流國家巴西，而不是相反的”
之后，佩德羅王子還正式對外發布聲明“為了所有人的利益以及為了整個民族的福祉，我決定對大家說，我將會繼續留在巴西。”
隨后，他正式宣布拒絕遵守葡萄牙制憲會議的要求。
當制憲會議得知這個消息后，也是本著一步到位的原則，直接宣布巴西政府非法，并對巴西發出了戰爭威脅。
而剛剛和騎兵部隊結束訓練，正在伊皮蘭卡河畔飲馬休憩的佩德羅王子得知消息后的第一反應便是將這份公務函件用馬靴踩進了泥里。
他翻身上馬沖著士兵們宣布道“是時候了不獨立毋寧死我們和葡萄牙決裂了”
制憲會議聞訊立即向巴西派出平叛大軍。
就在葡萄牙人到達巴西之前的10月12日，佩德羅一世則在里約熱內盧登基，加冕為巴西皇帝及永久保護者。
而在葡萄牙和巴西打打鬧鬧了幾年后，葡萄牙人終究是拿不下被皇家海軍開除軍籍的炸彈船狂人科克蘭將軍調教的巴西海軍。
而葡萄牙國王若昂六世看到兒子居然這么出息，在心酸自己淪為立憲國王的同時，對兒子都混成巴西皇帝的行為也是頗感欣慰。
所以，最終若昂六世還是讓葡萄牙承認了巴西的獨立地位。
佩德羅王子敢于和老父親過招，而他的弟弟也是不遑多讓的一位英雄豪杰。
本著半大小子打死老子的原則，在大兒子佩德羅王子帶領巴西開展給爸爸一個教訓活動的同時，二兒子米格爾王子也混成了葡萄牙專制主義分子的領袖，并趁著老爹手忙腳亂抽不出手的時候果斷開啟了他的滅爸行動。
1823年，專制主義者在米格爾王子的帶領下突然發難，兵鋒直指葡萄牙首都里斯本，要求解散議會、廢除憲法。
坐擁兩大孝子的若昂六世實在不能同時對付兩個兒子，于是不得不對叛軍做出讓步，將葡萄牙全軍總司令的頭銜封給米格爾王子。
老國王本想著現在兒子總該消停了，可沒想到第二年米格爾王子再次發難，但是這一次，早有防備的若昂六世讓他好好見識了一下什么是你爸爸終究是你爸爸。
叛軍遭到空前失敗，米格爾王子遭到逮捕。隨后，若昂六世宣布米格爾王子為不受歡迎的人，并下令將他驅逐出境，米格爾因此只能灰溜溜的跑到奧地利去抱梅特涅的大腿。
而到了1826年的時候，若昂六世在吃東西時，一個不留神把自己給噎死了。
雖然這個死法聽起來就和沙皇中風一樣不靠譜，但是務實的葡萄牙人還是很快接受了這個事實。
而國王的意外離世也帶來了一個新問題，那就是國王在去世前并沒有明確指定繼承人。
于是葡萄牙國內圍繞著王位繼承權的問題再次展開了熱烈大討論，自由主義者支持若昂六世的長子巴西皇帝佩德羅一世繼承葡萄牙王位，而專制主義者則支持次子米格爾王子。
在爭奪王位的過程中，把持著政府的自由主義者先下手為強，他們搶先宣布佩德羅為葡萄牙王國的合法繼承人。
而專制主義者則宣稱自由主義者違憲，他們認為佩德羅王子不能在身為巴西皇帝的情況下同時繼承葡萄牙王位。
眼見著兩派人馬就要在里斯本郊外互相比劃比劃了，急于解決問題的佩德羅連忙在1826年頒布一部大憲章，以取代1822年制訂的憲法。