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            第331章 申請授課!(1 / 2)

            宋河順手開了一個新程序,按伊雷馬實驗室數據,同步復現藥物預測流程。

            別人做的成果,他不敢全盤接收,還是親自上手驗證一下穩妥

            首先是經典的ddis預測,即藥物藥物相互作用,探討病人短時間服用多種藥物后,產生的復合效應。

            當初在京海大學實驗室,呂承恩講過中藥預測五原則,相反為制、相畏為制、相喜為制、相資為制、相惡為制,也是藥物和藥物相互作用的原理,只不過現代的ddis預測深入到分子層面了。

            之前宋河看相關論文時,見過基于圖卷積神經網絡的ddis預測,以及基于平衡理論的預測。

            前者太片面,只考慮鄰接矩陣元素。而后者則太絕對,總結起來就是“朋友的朋友是朋友”、“朋友的朋友是敵人”,但實際的藥物研發中,關系遠比平衡理論要錯綜復雜。

            電腦屏幕上,伊雷馬實驗室居然兩種方法都棄之不用,赫然使用了新方法進行ddis預測

            宋河研讀許久,基本明白了思路大數據庫推導

            伊雷馬實驗室嘗試將海量化合物進行拓展,梳理出親戚關系,畫出一個壯觀的樹狀圖,每個枝丫都連接一種相似的化合物。

            之后,再通過已經確定的化合物藥用特性,大膽猜測未知化合物的藥效。

            這感覺好比,知道丈夫是生物學家,知道妻子是短跑運動員,于是便猜測這對夫妻將來的孫子能夠一邊短跑沖刺一邊手拿顯微鏡觀察細菌

            本質上還是瞎猜藥物,但在瞎猜中多了一絲絲牽強附會的推理。

            “好難”宋河吐槽。

            他在帖子里尋找伊雷馬實驗室用的大數據庫。

            找了半天沒找到

            “怪不得呢原來公布的只是邊緣數據,最核心的沒公布啊”宋河搖頭失笑。

            沒辦法,他只得嘗試自己搜集數據庫。

            他先在網上尋找,用過相似工作方式的科研團隊。

            花了許久,總共找到兩個。

            一個是千度公司合作的研發團隊,通過大量食管癌病人的數據,尋找到22個顯著突變基因,隨后預測關聯出可行的藥物信息。

            一個是sk癌癥中心,開發了一個體細胞突變相關的知識庫,收錄了大量靶向藥。

            “都是做癌癥的數據庫,用不上啊”宋河撓頭。

            思前想后,他掏出手機,找相曉桐老師場外求助。

            “老師,我需要一個安眠藥相關的大數據庫,做藥物預測用,您知道從哪能弄到嗎學生萬謝”

            剛發消息,宋河馬上后悔,大半夜的,會不會打擾老師休息

            沒想到過了幾秒,回復便來了。

            相曉桐“我知道譚西教授的團隊自建了一個安眠藥數據庫,但譚西那人小心眼,斷不可能給你。”

            相曉桐“這樣吧,我團隊里有黑客,幫你上網抓一些相關數據下來,能抓多少不確定,你做個參考。”

            宋河連忙回復,“謝謝老師學生簡直不知道該怎么感謝您好了”

            相曉桐“回頭跟著我學腦的時候,好好干活就行。”

            一小時后,相曉桐一股腦扔來大堆數據文件。

            宋河打開看,每一份文件均為龐然大物

            海量的數據,雜亂不堪,有他想要的化合物分析,有奇奇怪怪的廢數據,大部分來自世界各地醫藥組織的數據庫,千奇百怪的語言齊聚一堂,光是機翻都要很久。

            如果自己單獨干,僅僅梳理完這些數據,恐怕都得拖到過年

            宋河幽幽長嘆一聲,看來這次做短眠藥,必須雇傭實驗團隊了

            和軍用的環形山炸藥不同,短眠藥這東西主要是商業價值,無需過于水泄不通的保密措施,招些可靠的人手來干活,注意分工即可。

            宋河在反間諜教材上,學過一種行之有效的保密方法,盲人摸象法。

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