回到電影中，“黑薔薇”就是對全球任何對美利堅不利的人和組織，都可以采取監聽、逼供、刺殺等非法手段。通俗的說，“黑薔薇”近乎于大明朝的東廠，這個東廠的爪牙遍及全世界。
“黑薔薇”組織在監聽中發現了一條重要信息，有個叫賽門的記者在通話中提到了“黑薔薇”，因此引起了“黑薔薇”的高度警覺，對其進行了全方位的監控，要挖出賽門的消息來源和背后之人。
而吳念祖也同時發現了賽門這個人，他從報紙上看到了賽門寫的職責中情局濫用法案的文章，還提到了自己和瑪麗等人，因此他也決心聯系到賽門這個知情者，想要獲得更多的信息。
不過他知道賽門肯定處于受到監控的狀態，因此直接將電話打到了賽門同事那里，通過賽門同事的電話和其約定了見面時間與地點。而這讓監視著賽門的人員一頭霧水，因為他們沒有監聽賽門同事的電話，不知道賽門要去干嘛，只能派外勤小組去跟蹤記者賽門。
吳念祖還沒等賽門到約定地點，便在他等車的時候路過他身邊偷偷往他口袋里面塞過去一部新手機。隨后等到電話響起，賽門一臉問號的拿出這個陌生的手機接了起來，而這也再次避開了組織的監聽。
吳念祖在電話中對賽門指出了他現在周圍好幾個人都在監視著他，為了幫賽門擺脫掉這些尾巴，吳念祖指揮他走到公交站旁邊，走到一個帶著帽子的男子身邊假裝說話，然后等到公交靠站擋住監控視線的一瞬間，便趁此離開。而可憐的帽子男則是被組織當成了接頭人給抓走了
而吳念祖則是趁機打倒了一個外勤的監控人員，幫賽門甩開了監控小組之后，兩人取得了會面。短暫的會面，吳念祖從賽門口中得到了部分消息，但是這時中情局的人已經又追了過來，兩人只能再次分開，吳念祖指揮著他逃離。
只不過賽門畢竟沒有接受過訓練，一時慌亂自己亂了陣腳，吳念祖也只能親自出面，在一個廁所里干掉了追來的4個中情局特工。不過他也因此再次暴露在了中情局的視野中，組織的負責人直接派出了殺手要直接干掉兩人。
而這次，記者賽門再次沉不住氣，沒有聽從吳念祖的指揮開始亂跑，被殺手用狙擊槍一槍擊斃。吳念祖只能從賽門身上趕忙拿走他的隨身資料從而離開，從上面的蛛絲馬跡發現記者賽門的消息來源，也就是內線在西班牙的馬德里。
內線丹尼爾看到了記者賽門被殺死，第一時間就帶著資料逃跑了。在這里，吳念祖想要找的內線已經人去樓空，不過他卻撞上了組織派來的人員，他控制住了組織的后勤妮基，而她恰巧正是吳念祖曾經在組織中的戀人。
從妮基口中得知，組織還派出了第二隊特工，吳念祖便直接打電話報警這里有槍戰，當地警方趕到后正好和第二隊持槍的特工撞了個滿懷，然后不知道他們身份的警察直接將他們拘捕，吳念祖也帶著妮基趁機逃脫。
兩人趕往了下一個地點，也就是摩洛哥，去尋找內線丹尼爾。而組織的殺手也已經找到了丹尼爾的蹤跡，并且當著吳念祖的面干掉了丹尼爾。
由此，這里也呈現出了本片甚至是眾多動作電影中頂尖的一場全實拍無特效的追逐戲，而且能夠清晰地看出，這里吳念祖完全沒有用替身，各種在樓宇間輾轉騰挪跳窗戶，看得觀眾大呼過癮。
這里的全實拍可不是那么簡單的，因為不僅僅是吳念祖要跳，為了拍到足夠有視覺沖擊力的效果，攝影師扛著攝像頭跟著吳念祖一起跳了
最終吳念祖跳進窗戶，在一棟普通的小屋中截住了趕去殺妮基的殺手，和殺手兩人展開了激烈的肉搏，拳拳到肉。頂尖的特工，隨便拿起什么都是致命的武器，一條毛巾一本書都能把人給干掉，最終一番精彩的打斗中，殺手被吳念祖弄死，而妮基則使用殺手的手機發信息回去說任務已經完成。
接著，吳念祖不想要連累老情人，讓其剪短了頭發并染上了黑發，和自己分開。而他則是去了當地的停尸房，通過賄賂的方式拿到了丹尼爾殘存的資料，從而在這里找到了中情局紐約分部隱藏的地址。
同時，中情局這邊的蘭蒂則是從下屬這里知道了伯恩換了新的護照進入了美利堅。蘭蒂知道伯恩不會如此粗心，這么做是想和自己取得聯系。
蘭蒂雖然在中情局工作，但是她一直都反對“黑薔薇”計劃，也就是說，她是中情局內部的好人。
電影嘛，想要在老美過審，就不能全方位地黑老美，必須在其隊伍中設定一個角色充當好人，最后和主角一起推翻惡勢力。
隨后，吳念祖來到了中情局大廈的對面，一邊用望遠鏡觀察著，一邊和蘭蒂通了電話。而這通電話自然又被“黑薔薇”計劃的負責人諾亞監聽到，得知吳念祖和蘭蒂約定了地點見面，立馬興奮地親自帶人跟蹤蘭蒂來到了約會地點，在這里布下了天羅地網。
然而正當諾亞想著能將吳念祖這個危險因素消除掉的時候，他的電話忽然響起。等他接起來后，里面傳出的赫然是吳念祖的聲音“你不會以為我會真的去赴約吧”