加西亞作為戰爭失敗的直接負責人處境艱難，而坐在巴西帝國位子上面的佩德羅二世日子同樣不好過。
戰爭失敗，原本隱藏起來的矛盾全都浮出水面。
國家經濟方面，佩德羅即位前期積累的家底在巴拉圭戰爭中消耗一空，幾十萬青壯年男子從事與戰爭相關的行業，促進了巴西軍事工業的發展，但是對于國家宏觀經濟發展造成重大損失，戰爭前夕正在進行的工業化建設被迫中止，大量的鐵路、工廠建設成了爛尾工程，前期投入的巨大財政資金短時間內看不到盈利的希望。
農業、輕工業發展減緩甚至倒退，在戰爭開始一年后，巴西帝國就開始從英法等國那里進口日常生活所需的糧食藥品和輕重工業產品，政府和民間積攢的財富迅速流向英法等國，直接促進英法等國工業的發展。
巴西帝國發動戰爭不僅沒有得到一塊土地和一個英鎊的賠款，連最南部的南里奧格蘭州也被華人獨立軍奪去。
偷雞不成蝕把米，佩德羅二世心情十分復雜，即為當初輕易挑起和巴拉圭的戰爭后悔，也埋怨加西亞作戰失利，讓華人獨立軍鉆了空子致使主力部隊全軍覆沒，假使沒有華人獨立軍橫插一腳，巴拉圭戰事也不會敗的如此難看。
后悔、怨恨，佩德羅二世的心情難以用語言描述清楚，不過即使心里如何不甘，結局也不能改變，佩德羅二世眼下要做的就是處理戰爭失敗帶來的一系列不利影響。
首先，加西亞作為保皇派的核心人物，佩德羅二世不能扔下不管，否則不僅會令保皇派寒心，同時也會增加共和派的氣勢，削弱巴西皇室的影響力和皇帝對巴西的控制力。
其次，巴拉圭戰爭失敗后，玻利維亞、秘魯蠢蠢欲動，秘魯向巴西政府遞交了商議兩國有爭議地區的歸屬問題，而玻利維亞總統阿道弗則公開宣布前總統與巴西所簽訂的一切協議無效，督促巴西軍隊退出占領的玻利維亞土地，否則玻利維亞軍隊將進攻侵略的巴西軍隊。
一石激起千層浪，巴西軍隊不過失敗過一次，周圍國家就恨不得沖上來從巴西身上撕下一塊肉，佩德羅二世不認為玻利維亞、秘魯有這樣的實力，因為在這之前，進攻巴西馬托格羅索州的巴拉圭軍隊已經被巴西軍隊驅逐出國境，如果不是巴拉圭戰事導致巴西軍隊主力損失慘重，進攻馬托格羅索州的巴拉圭軍隊將會付出巨大的代價。
秘魯、玻利維亞的實力不放在佩德羅二世的眼中，不過秘魯、玻利維亞、巴拉圭、華人獨立軍四個勢力范圍帶來的威脅也不容小視。
如果四個勢力暗中結成同盟對付巴西，巴西帝國就危險了。
佩德羅二世的擔心有些多余，且不說華人獨立軍和秘魯、玻利維亞都發生過沖突，就是四大勢力結成同盟，因為地理環境的阻隔，也不能對巴西造成根本性的傷害。