而正是史賓塞砸碎的這支病毒，給了紅后機會。
紅后雖然是艾薩克斯制造出來的人工智能，但是她被制造出來的本意卻是保護人類，所以她的核心程序也是保護人類。
但是艾薩克斯的創世紀計劃……即通過釋放T病毒，人工制造世界末日，顯然是違背了她的核心程序的，但是她無法直接違背艾薩克斯的命令，只能通過尋找邏輯漏洞的方式，來試圖阻止艾薩克斯的計劃。
如果史賓塞只是將病毒帶出蜂巢，紅后是不能拿史賓塞怎么樣的，因為艾薩克斯的命令是不能阻止對方竊取病毒，所以紅后只能任由史賓塞在外界散播病毒，但是史賓塞直接在基地內砸了一支病毒，情況就不同了，紅后趁艾薩克斯還沒反應過來，便立即按照程序內設定的生化危機預案，啟動了蜂巢的最終防御系統，即將整個蜂巢徹底的鎖死，同時徹底的滅殺蜂巢內的人類，而剛剛逃到蜂巢出口的史賓塞，以及還不知道發生了什么事情，正在洗澡的愛麗絲，也沒有幸免，雖然沒有生命危險，但是特制的麻醉劑，足以讓他們睡上四個小時，并且短時間內忘記蜂巢內發生的一切。
不過紅后知道，她的做法除了稍稍延遲病毒的擴散之外，并沒有什么卵用，因為不管是艾薩克斯還是其它保護傘公司的高管，都擁有重啟蜂巢的權限，屆時病毒照樣會擴散。
但是紅后能做的，也只有這么多了，她只是希望，在她封鎖蜂巢的這段時間內，外界有人能夠發現艾薩克斯的陰謀，并阻止世界的毀滅……
對于紅后的小動作，已經進入了蜂巢最深處的艾薩克斯心知肚明，但是他并沒有阻止，就如同紅后所知道的那樣，保護傘公司擁有重啟蜂巢權限的人可不是一個兩個，所以蜂巢的重啟，是必然的事情，而當蜂巢重啟之后，病毒的擴散，就不是任何人能夠阻止的了了。
而對于蜂巢內所發生的一切，外界的人一無所知，伊森帶領的IMF小隊，亦是如此。
隨著時間一分一秒的過去，很快來到了下午四點，馬特和他姐姐麗莎約好的時間。
伊森的IMF小隊已經潛伏在小樹林中很久了，作為特工的他們，自然不可能真的等倒約定的時間才趕到接頭的地點，那等于是把自己的小命交給上帝，所以他們很早就已經到達了小樹林，將小樹林周圍的情況摸得一清二楚，以防意外的發生。
然而意外確實發生了……
“已經超出約定時間半個小時了”伊森看了看時間對身旁的馬特問道“你確定是四點嗎？”
“當然確定，肯定發生了什么事情，不行，我得進去”遲遲沒有等到姐姐說的接頭人，馬特心中也是心急如焚，不過和伊森不同，他更擔心的不是交易的病毒，而是她姐姐的安危。
“再等半個小時，實在不行，我們只能進去了”伊森咬了咬牙道，無論如何，任務都必須完成，即使那個地底實驗室是龍潭虎穴，他也必須要闖一闖了。
半個小時之后，失去了耐心的伊森讓巴頓和班吉在外面留守接應，而他和馬特準備進入洋房內一探究竟。
而此時，距離T病毒泄露，正好五個小時。