作為前燕皇帝的慕容儁，一直在尋找機會搞死慕容垂以絕后患，但是都被戰功卓著，威震領邦的慕容恪所阻。
然而作為前燕的帝國柱石，慕容恪不可能無時無刻保護著慕容垂，總有在外征戰，顧及不到之時。
當時慕容垂娶了段部鮮卑的首領段末柸的女兒段氏為妻，段氏才高性烈，名聲遠播，與皇后可足渾氏不睦，被對方所忌。
經常吹枕邊風的向慕容儁說對方的壞話，加上慕容儁對慕容垂也有除掉之心，兩人一拍即合的開始對慕容垂夫妻進行布局。
沒過多久，他們布局在慕容垂府上的下人舉報段氏及吳國典書令高弼參與巫蠱，意圖把慕容垂牽扯進來。
兩人下獄后，被施加重刑，妄圖屈打成招，然而兩人始終“志氣確然，終無撓辭”。
慕容垂非常心痛，暗中派人告訴妻子段氏：“每個人都會有一死，夫人不要在受此苦痛了，把我招了吧，我們夫妻二人一起走上黃泉，也算有個伴。”
其妻段氏扼腕嘆息道：“誰又愿意受如此折磨而死？但是我們明明沒有做此等禍國之事，如果自己誣告夫君為謀逆，既辱沒了自己的祖宗，也對不起夫君的恩情，妾身絕對不會做這樣的事情。”
沒過多久，段氏熬不住酷刑，自盡于牢獄之中。
自此慕容垂與慕容儁、皇后可足渾氏一系結成了永遠也化解不掉的死仇。
無法取得證據扳倒慕容垂，只能封他為平州刺史，以鎮遼東，讓對方遠離燕國的核心區域。
為了紀念自己的妻子，慕容垂將段氏的妹妹納為繼室，皇后可足渾氏非常厭惡段氏部落的女人，又派人讓慕容垂將自己的第二任妻子休掉，并將其妹妹嫁與慕容垂，這愈發的讓慕容垂不甘。
雖然名義上休掉了自己第二任妻子，慕容垂依舊將其帶在身邊。
后來慕容垂隨兄長慕容恪攻克洛陽，當時的慕容恪如日中天，沒有人敢違逆他的意思。于是，慕容垂被封為征南大將軍、荊州牧，都督黃河以南的十州軍事，鎮守南方，防止西邊的苻秦與南方的晉朝。
慕容垂這些年跟在慕容恪身邊所表現出來的軍事實力深受兄長的驚訝與認可。
慕容恪臨終之時，深知燕國的頑疾，皇帝慕容暐手中無實權，太后可足渾氏與輔政的慕容評會繼續執掌大權，他們兩人皆是無能之輩。
自己在世時，他們不敢僭越。自己去世后，無人可以限制他們，于是向皇帝慕容暐以及侄子樂安王慕容臧舉薦了慕容垂。
病榻上的慕容恪虛弱的說道：“微臣通讀史書，知道傅說這樣的圣人舉薦人才時，連板筑之人都可以勝任，更何況是國家的懿親呢！慕容垂兼具文武之才，才能僅次于管仲、蕭何，可以勝任大司馬的職位。
我死之后，陛下可以用慕容垂治理國家并統領軍隊，苻秦與晉國絕對不敢侵犯我們，不然必能讓對方有來無回。
而慕容垂也懂得燕國未來的發展方向，有他處理政務，必定會讓國家安穩，即使有不臣的人犯上作亂，也能迅速平定。”