之后大漢王朝各地動亂不堪，傅燮跟隨皇甫嵩前往各地平亂，多立戰功。
戰事結束后，論功行賞之時，傅燮功高本應該封侯，但因為曾經上書漢靈帝而得罪了十常侍之一的趙忠。
趙忠從中作梗，誣陷傅燮，漢靈帝還記得傅燮曾經的上書，知道對方乃忠臣。
并沒有問罪，但也沒有大肆封賞，只是任命其為安定都尉。
沒過多久，傅燮因為生病，辭去了安定都尉，回家養病。
病好之后，朝廷征傅燮入朝廷擔任議郎一職。
中平二年（公元185年），邊章、韓遂率領涼州叛亂軍寇略三輔地區，朝廷派遣皇甫嵩率領北軍督董卓等人前去平亂。
當時的朝廷本就國庫空虛，涼州又經常叛亂，導致朝廷不得不派遣重兵前去平亂，隨之而來的就是徭役愈發的加重。
司徒崔烈在朝廷會議上提出放棄涼州的建議，漢靈帝于是召集百官討論放棄涼州的可能性。
司徒崔烈堅持己見，言語之中非常激烈。
傅燮挺身而出，手指崔烈道：“下官認為，只有斬了司徒，天下方可安定。”
百官面面相覷，不知傅燮這是唱的哪出戲！
與崔烈交好的尚書郎楊贊立刻說道：“傅燮在朝廷之上，侮辱重臣，理應治罪！”
漢靈帝素知傅燮忠義，立刻詢問道：“為何要斬司徒崔烈？”
傅燮面色威嚴，鄭重的說道：“當年匈奴單于冒頓十分猖狂，完全不尊重大漢王朝與呂后，然而樊噲卻說，給他十萬之兵，他能掃平匈奴。
樊噲慷慨陳詞，并未失去人臣之禮，但是當時匈奴勢大，高祖統領三十萬之眾，尚且被圍困于白登山上，樊噲又如何能與高祖相提并論？
因此，季布仍然說‘樊噲誤國，可斬之！’
如今涼州為天下的要沖，國家的藩衛。
高祖好不容易才平定海內，使酈商平定隴右地區。
武帝開拓涼州，設立四郡，將涼州收歸大漢所有，當時人都認為這樣好比斬斷匈奴人的右臂。
現在涼州治理混亂，使得一州之內，多次發生叛逆，已經嚴重影響到整個大漢的天下。
海內為之騷動，陛下為此寢食難安。
崔威考（崔烈，字威考）位列三公，不能為國家出謀劃策化解疑難，卻要割棄一方萬里疆土，微臣對此感到十分不解。
若我們大漢放棄西北，而讓游牧民族得到涼州，則將為患數世。沒有強兵猛將，幾乎很難再次奪回涼州。
況且失去涼州則關中危險，歷代先皇的陵寢皆在關中的長安城，沒有涼州作為藩屏，游牧民族的鐵蹄可以直逼關中地區。
關中有失則洛陽危險。
如果崔烈不知道這個道理，那就是愚昧無知，如果他明知而為，那么他就是對大漢不忠！
若是愚昧無知，又如何能坐到三公的位置上？
若是對大漢不忠，那就是奸臣，微臣請斬對方，何錯之有？”
漢靈帝認同了傅燮的意見，但也沒有處罰崔烈。
經過此事后，朝廷百官都敬重傅燮的敢言敢做，每當公卿職位有空缺時，大家都推舉傅燮擔任。</p>