除了殺降，王全斌在禍害百姓方面也有著極高的造詣。其麾下某位大將“割民妻乳而殺之”，跟小鬼子一樣慘無人道。趙匡胤聽說后，立刻命令該將領回朝，然后斬首示眾。
朝中很多官員為這位將領求情，趙匡胤流著眼淚說道“王師入蜀，解救萬民，她一婦人有何罪，要如此殘忍虐殺必須要給蜀人一個說法”
其實這件事要跟呂余慶殺鬧事的軍校串聯起來。如果說“軍校搶劫案”是王全斌投石問路、主動挑釁朝廷的話，那么“殘殺蜀婦案”則是朝廷敲山震虎、主動震懾王全斌，兩件事都以朝廷的勝利而告終。那些求情的高官們也不是替嫌犯求情，而是站隊王全斌，越是有人求情、求情的人越多，趙匡胤就越是要殺之。朝廷是趙匡胤的朝廷，不是王全斌的朝廷。
隨后，趙匡胤調康延澤為普州刺史，率兵平叛。康延澤找王全斌要兵，王全斌只撥給他區區一百人。
康延澤邊走邊招募部眾，邊走邊培訓，等走入叛軍控制區的時候，已經有了一千人。而這臨時拼湊起來的一千人，要面對的是全師雄手下大將劉澤率領的五萬叛軍。
康延澤宣講朝廷政策，曉之以情、動之以理，很快就收編了兩千賊眾，發展到三千余人。劉澤率三萬賊眾出戰，康延澤以少勝多，三千勝三萬。隨后，康延澤進駐普州。在康延澤的恩威并施之下，劉澤終于率眾來降，全師雄叛軍在東川的主力勢力被瓦解。趙匡胤立即任命康延澤為東川七州招安巡檢使，負責東川地區的剿匪工作。
王全斌畫虎不成反類犬，原本要養寇自重，到頭來卻養虎成患。為了平定叛軍，王全斌不得不請求朝廷派兵救援。朝廷派丁德裕、張嶼、王玨等赴援；又將興元安守忠任命為漢州刺史。
安守忠，沙陀人，祖父安金全，父親安守琦。安守忠同志根紅苗正，能力出眾，顧全大體，深得趙匡胤信任，初收兩湖時，就被任命為永州刺史，安撫地面，之后又調回汴州，守護河陰屯田兵。河陰是以汴州為中心的龐大水路網絡的重要節點，是大宋這臺戰爭機器的馬達，關乎帝國命脈，能任職于此的必須是值得信任且能力出眾的同志。消滅后蜀，趙匡胤又讓安守忠權知興元府，坐鎮這個中原與蜀地的連接點、樞紐重鎮。
在興元府任上，安守忠盡忠職守，甚至自掏腰包，補貼來往使節，成為中原與蜀地的重要橋梁。每當朝廷要派使節入蜀，趙匡胤都會親自叮囑使節，說你們見到安守忠同志后，一定要多多向他學習
現在，趙匡胤將安守忠派往漢州，深入蜀地。換句話說，朝廷的勢力已經滲透到了蜀地，王全斌的如意算盤徹底泡湯。
乾德四年96612月，全師雄在戰斗中負傷，很快傷病發作而死，其殘余部隊很快就被完全鎮壓下去。持續了一年多的全師雄叛亂終于被平定。
乾德五年967正月，蜀地臣民告御狀，控訴王全斌、王仁瞻、崔彥進等在蜀地的種種不法行為。于是趙匡胤將入蜀作戰的將領們同時召還。由于此前中央勢力對蜀地的滲透，王全斌等人無力抗旨，只得乖乖回朝。
王仁瞻最先回來，他要惡人先告狀，推卸責任、甩鍋給戰友。面見趙匡胤之后，王仁瞻擺出一副供認不諱、和盤托出的樣子，幾乎是告所有戰友們的黑狀，“歷詆諸將過失”，想以此掩蓋、減輕自己的問題。
聰明不過天子，實際上王全斌、王仁瞻等人的身邊早就密布朝廷眼線，他們的一舉一動、一言一行都在趙匡胤的掌握之中。
等王仁瞻唾星四濺地表演完了，趙匡胤皮笑肉不笑地問道“私納李延珪姬妾，擅開成都府庫貪污公款，也是他們干的嘍”
王仁瞻大驚失色，汗流浹背，急忙跪地磕頭，嚇得一句話也說不出來。
在處置發落的方面，也體現出了趙匡胤的領袖氣質。
首先是指出問題的嚴重性。給他們上綱上線，扣上一個他們承擔不起的罪責私吞軍餉，殺降致寇。一句話，蜀地一年多的叛亂，全是因你們擅自削減蜀兵的軍餉，甲級戰犯的干活另外，還膽敢殺降，違反我軍優待俘虜的政策，性質極為惡劣、社會影響極壞。