朱慈烺此舉，將練兵權、統兵權和調兵權完全分開了，軍屯部只有練兵，各地將領只有統領權，至于調兵權只能由自己和軍機部發出。
這樣有效的預防了軍隊私自調動的情況，而且軍機處全由武將擔任，不會造成兵部那樣不懂軍事的文官當家的局面，當然了，朱慈烺也不會傻到給軍機部駁回自己命令的機會。
說白了就是朱慈烺借著軍機部限制武將，不過軍機部由軍隊的幾位最高武將擔任，這樣可以避免讓武將們有抵觸心理，畢竟這也變相的代表了武將的職權變大了。
奉天殿中，所有人聽得心潮澎湃，這幾部成立后，標志著以皇太子為核心的軍事政治集團的正式形成，他們這些人將來都有從龍之功，皇太子登基后，這幾部的人員就是現成的六部大臣。
朱慈烺也是這么想的，原本他是準備去南京后再做調整的，將南京六部的人全部趕走，重新安排自己人，后來仔細思考了一番，還是決定先調整，讓他們先豐富經驗后再正式上崗，日后安排六部的人選還要重新斟酌。
現在的部門雖然看起來多，但仍然不全面，比如說刑部、工部和禮部的職權沒有涉及到。
這些部門朱慈烺暫且不打算動，因為他們不僅不能給自己帶來絲毫好處，還會給自己帶來無窮的麻煩。
比如說禮部，掌管儀制、祭祀、典禮等事務，還有學校、科舉、外交之事，很多事情都是皇帝才能決斷的，現在還是不插手為好。
刑部也是，全國的犯人砍腦袋都需要最后經過皇帝勾選名單，這也是皇帝的特權，朱慈烺南下以來已經先斬后奏殺了那么多人，皇帝老爹沒追究已經很寬宏大度，如果自己連刑部都要插手，那就是真的不知好歹了。
朱慈烺環顧一圈道：“各部已經成立，除軍機部外，其余各部設部長一人，副部兩人，司長十人，主事十人，各部部長在十日內拿出一份人事任用名單交給本宮，本宮批復后各部官員即可上任，”
“是！”眾人齊聲高呼。
眾人之中，程國祥的心情久久不能平靜，并不是激動造成的，而是他內心深處有種深深的擔憂，為京師那位身穿十二章龍袍的天子擔憂。
近日來，程國祥接管了楊廷麟的所有錢糧收支賬冊，當他翻閱統計時，整個人都被震住了，皇太子掌握的錢糧，居然遠比大明國庫中的要多！程國祥從錢糧收支記錄中大致判斷出，皇太子最起碼在養三十萬大軍！
皇太子年紀輕輕就表現出了雄主氣魄，現在軍事政治一起抓，以他目前所掌握的實力，朝廷已經無法掌控了。
特別是這幫武將，從在京師就一直緊緊跟隨皇太子，現在個個升官發財，還手握重兵，皇太子集團的前進步伐再也沒人可以阻攔了，真擔心日后會發展成什么樣子。
軍事行政機構完善之后，朱慈烺當即又宣布了出兵南下平亂的命令。
朱慈烺道：“如今已經進入五月份了，張獻忠、羅汝才兩個賊首依然冥頑不靈，本宮決定出兵南下，一舉將之蕩平！”
朱慈烺命令天武軍第二師做好出征準備，糧草物資開始籌集，又命令黃得功即可返回武昌府領天武軍第一師一萬人馬進駐江西南昌府。
自從朱慈烺在三月份下令左良玉領兵去景德鎮布防，到現在已經過了將近三個月，左良玉依然在九江府，遲遲沒有動靜，對朱慈烺的命令壓根沒當回事。
張獻忠和羅汝才二人的數萬流寇直接席卷了江西，造成江西多地遭到劫掠和破壞。
朱慈烺極為惱怒，覺得左良玉已經沒有存在的必要了，此次南下江西平亂，順便將他扔進歷史的垃圾桶里。