西軍都督府，攻略漠西蒙古，準格爾汗國、葉爾羌汗國、和碩特汗國等，范圍到中亞。
東軍都督府，負責補位機動，哪方有戰事便出兵助攻。
為了調動將士開疆拓土的積極性，朱慈烺實行領地封邑制，只要軍功卓著，為大明開疆拓土者，皆可賞賜領土，給予土地使用權。
比如，周遇吉如果能打下漠西一個汗國，為大明開疆拓土百萬平方公里，將會得到一縣之地的領地，擁有領地內所有土地使用權、經濟自主權、人事任免權。
在繳納賦稅和盡其他義務的條件下，周遇吉的子孫后代亦可世襲領地，但不能轉讓，直到爵位世襲完了為止，朝廷再收回土地使用權。
如果周遇吉子孫后代有人出息了，再次立功，朝廷優先給周家續上該領地的土地使用權。
為了防止封國的出現，朱慈烺定下規定，所封領地不得超過一縣之地，土地上限為五百萬畝地。
家族領地內的私兵不得超過一千，必須遵循《大明律》，受朝廷節制。
也就是說，在封地內，經濟上不管你怎么折騰都行，政治上和軍事上，少折騰，老老實實享福，多培養子孫后代成才續杯。
自古以來，中國歷朝歷代對外擴張乏力，多以守成為主。
即便出現幾個喜歡擴張的朝代，也不懂轉化收益，盡是往里賠錢，搞得所有人都不愿去打仗擴張。
不像此時的西方，大航海后全世界到處跑，打仗搶地盤，搞殖民地，販賣人口，挖黃金發財。
一方得到好處，周圍個個跟風，積極的搞殖民，從方方面面影響后世幾十代人。
關于中小級別將士的封賞，都在各都督府轄下的各省執行，根據軍功大小賞賜田地和銀錢。
經過長年戰亂，大量土地荒蕪，現在朝廷可分配的土地資源太多了，尤其是北方。
南方除了直隸、浙江、湖廣等地，其余地方也的地廣人稀，有著大量土地沒有利用到位。
對于一些退休的軍人，朱慈烺也對他們提供了就業機會，自主選擇，可以在本地當個里長、村長之類的基層干部，或者進入軍工廠。
甚至可以進入皇家集團的武裝力量，成為遠洋貿易，殖民海外的雇傭兵。
為了增強五軍都督府下軍隊的戰斗力，朱慈烺考慮再三，將練兵權和統兵權合二為一，朝廷只保留調兵權。
北伐的幾場大戰，雖然打的漂亮，但同樣暴露出明軍很多問題。
比如各部將領與士卒的磨合、火器搭配運送、后勤等方面，都需要再度加強。
一些部隊差點出現北宋時期“兵不識將，將不識兵”的局面，影響軍隊戰斗力。
軍隊應該是一個高度集中統一的武裝集團，因為只有高度的集中統一才有較強的戰斗力。
從這個角度來看，大明以前的五軍都督府，權力削弱，兵部權力的加強，這其實是一種進步，對增強軍隊戰斗力有利，兵部由文官掌握，不會對皇權構成威脅。
可以說，明后期基本建立了既能增強軍隊戰斗力，又不妨害中央集權的中央軍事領導體制。
然而這種領導體制并不完善，兵部文官們對前線指揮干預過多就是其中之一，外行人指揮內行人，盡他媽的添亂！
因此，接下來的大明朝廷格局，朱慈烺將會徹底的進行文武分治，政務與軍事分開。