木葉46年，風之國砂隱村第三代風影神秘失蹤。
三代風影失蹤后，沙隱村傾盡全力尋找三代風影，由于大力尋找的緣故，幾乎各大國都得知了三代風影失蹤的消息。
一村元首失蹤，其他國家得到消息之后自然各有反應，利益糾葛，趁虛而入，又有有心人在中引導……戰爭，爆發了。
砂隱村三代風影失蹤，起到了一個導火索作用，和平不到十年的忍界，繼承了上一次大戰的恩怨糾葛，這是上一場忍界大戰的延伸，又是一次波及整個忍界的大戰。
因為憎恨和仇怨而產生的戰爭，因為戰爭而新增的仇恨，周而復始，不停的戰斗，無止盡的戰爭……
三代風影失蹤，彼時的木葉正是是三代火影在位，年過半百的三代火影猿飛日斬已經開始從巔峰期衰弱，下一代繼承者的風波也由此橫生波瀾。
火之國內部，近些年也極為不平穩。
二次忍界大戰之后，代理火影，宇智波一族強者宇智波盛、日向一族宗家日向馨與千手一族分支美黛子三人結伴游歷大陸。
三忍之一，千手一族嫡傳后代綱手，辭去醫療部長職務，隱居原本的千手舊宅深居簡出，繩樹加入醫療忍者部參贊火影政事。
三忍之一，狂鬼自來也離開木葉游歷。冷君大蛇丸癡迷科學研究，多年沉浸實驗室之內，少問世事。
三忍之一自來也弟子，木葉人柱力漩渦玖辛奈夫家波風水門嶄露頭角，成為繼白牙之后的又一暗部高手。
原本的暗部部長，有著白牙之稱的旗木佐云，于六年之前的任務當中出現重大紕漏，被同伴指責失職，之后失去消息，疑似自盡……
風之國砂隱村亂象頻繁，最終引發動亂，高層為了統一思想轉移壓力，發動了和火之國木葉村大戰。
著名的第三次忍界大戰開端之局，桔梗山之戰就此爆發。
……
“任務世界：本源世界——火影忍者
主線任務：世界探索，探索整個世界的終極奧秘……
支線任務：眼睛的羈絆……
提示1：禁止向土著人物泄露有關主神空間的信息，否則消音處理，扣除一百積分。
提示2：檢測到輪回者和當前世界存在羈絆關系，開啟羈絆繼承模式，繼承之前與當前世界的所有聯系。”
“探索任務！世界的終極奧秘？”
木葉村之外的一處荒山，五道身影同時遙望著遠方的火影巖所在，初代、二代和三代的面孔遙遠可見，古盛卻沒有那么多心思去觀察這些。
“羈絆繼承，你們幾個……”
一邊的柳黛玫好奇地看了看旁邊裝束各有不同的同伴，古盛、楚馨和美黛子三人的額頭佩戴著木葉的護額，而涼子則是水之國霧隱村的裝束與護額。
“戰爭，又要爆發了……”
察看著腦海中的一些世界概況基本訊息，楚馨嘆息一聲，上一次她和美黛子進來的時候也差不多，一進來沒多久就是大戰爆發，這一次也差不多，合著這個世界每一次重要節點都是大戰爆發么！