時間到了隆慶六年六月，隆慶駕崩，萬歷即位。吏部按照習慣提出起用隆慶年間因言獲罪的官員，石星名列其中，高拱看了才想起他，不過沒有阻攔，因此石星得以官復原職。
同年八月，石星抵京，此時高拱早已氣消，反而還“補償”了石星一下，讓他由原官給事中晉升為尚寶司少卿。
萬歷二年八月，石星因為此時已經磨平了棱角，又知道了徐階當年與高拱之爭的內情并不是他所想象的那樣，對高黨的態度開始出現變化，于是由尚寶司少卿改任大理寺右寺丞，不久又升為大理寺左寺丞。
這當然是高拱的意志體現，因為尚寶司是個清水衙門，但級別還可以，高拱把石星放在尚寶司，一則是從品級上補償一下，一則也是觀察一下石星的態度。如果石星還冥頑不靈、死不悔改，高拱當然也有辦法整治。
不過既然石星已經“知錯”，高拱當然還是秉承提攜后輩的原則，又用了他。
然而，之前的打壓對于石星來說或許并不能完全釋懷，他此后雖然從整體上偏向實學派，但個別時候也不完全站在實學派一邊，尤其是在高拱去世之后。
比如說他在兵部的時候就曾經彈劾過時任遼東巡撫的高務實當時高務實計殺葉赫二貝勒，石星彈劾他擅起邊釁。石星認為葉赫的事情根本沒到需要用這種方式殺人的地步，高務實這一殺有“不教而誅”之意。
這道彈劾沒起什么鳥用，朱翊鈞既沒有同意，但也沒有直接處理石星，只是把彈章留中了。
這事高務實是知情的，不過他知道朱翊鈞當時的意思石星整體來說干得還不錯，只是他當初被打壓了一番之后，雖然偶爾還會有些書生意氣，但在大政看法上卻似乎有些轉向“鴿派”，出了名的不喜歡看見“不必要的戰爭”。
當時兵部全是主戰派，朱翊鈞認為留著一個主和派多少也能有點警醒作用，于是就沒處理這茬，只是把事情和高務實私下說了說，免得高務實不明圣意。
后來高務實自己進了兵部，曾找機會和石星聊起這件事，石星表示他倒也不是一味主和，而是他生怕當時這一仗導致遼東大戰，女真各部徹底反了。這里的前提人盡皆知那年朝廷沒錢了，再打大仗會出大問題。
總體來說，高務實覺得石星基本上算是略微傾向實學派的中立官員，但他內心深處對高家人可能仍有些介懷。不算大事，也不能算沒事。
如今石星做了工部尚書，會不會對朝局有什么影響，實學派內部也還需要討論。高務實也好，梁夢龍也罷，對此都不是很吃得準。
唯一的好消息大概就是如今皇帝的壽宮萬歷定陵正修到緊要關頭，石星這位工部尚書肯定馬上要加“總督陵工”，在壽宮修建完成并驗收之前，他大概沒什么工夫插手其他事。
沈鯉、石星的問題暫且打住，接下去還有兩位“老七卿”也得關注一下。
之前說過，吏部尚書天官楊巍本身是個中立派，因為與張四維交情非常好，所以一貫表現得就像是個實學派官員一般。